1、蒸煮消毒法把已配制好的培养土，放入适当的容器中隔水在锅中蒸煮消毒。这种方法只限于小规模栽培少量用土时应用。此外，也可将蒸汽通入土壤进行消毒，要求蒸汽温度在100℃至120℃之间，消毒时间40至60分钟。
2、福尔马林消毒法用福尔马林对培养土整体消毒，其方法是用福尔马林(40%甲醛)200至300毫升，兑水25至30千克，喷洒在1000千克培养土中，充分拌匀后堆置，堆上覆盖塑料薄膜等物，堆闷48至72小时，以达到彻底杀菌的效果。然后揭开塑料薄膜等覆盖物，经1至2周后，把土弄松散些，待土壤中药味散发后使用。
3、二硫化碳消毒法把培养土堆积后，在土堆的上方穿几个孔，每100立方米土壤注入350克二硫化碳，注入后在孔穴开口处用草秆等盖严，经过48至72小时的堆闷，除去草盖，摊开土堆，使二硫化碳全部散失即可。
