微型盆景经多年培养后，老根、残死根充满盆内，影响新生须根的生长，必须即时进行翻盆换土。一般草木类、竹类间隔l～2年，针叶类和雀舌黄杨生长缓慢，3～4年翻盆1次。主要根据植物不同品种和生长情况灵活掌握。翻盆以在春季树木发芽前进行最好。翻盆前要使盆土稍干些，以便盆土根系的脱出，然后用细竹签剔散盘结根系的泥土，对根系进行修剪整理，理直根系，剪除过长或衰老残死的须很。
对生长良好的根系尤其须根不要修剪过多。根据植株长势可换较大的盆，也可还用原盆，甚至因长势不好换入较小的盆内。由于微型盆景用盆均很小，盛土不多，一定要选用质量好的培养土。盆底的排水孔可垫上一块塑料窗纱，而不用瓦片，以免瓦片占用空间太大减少了盆土的容量，上好盆后要适当遮荫。
微型盆景的养护，比—般盆景养护要复杂得多。这是因为盆小，盆土少又不留水槽，所以平时浇水无法浇透。最好的办法就是利用浸盆法灌溉和施肥。浸盆就是将盆景盆浸入水中，深度为盆高的一半，使水从盆底的排水孔进入盆中，直至盆土全部湿润将盆取出。浸盆春秋早晚各1次，盛夏炎热季节每天要数次，主要根据盆土干湿情况而定。
而且要用细孔喷壶对植株和四周喷洒，以造成湿润的小气候，有利植株生长。如用自来水应事先在缸中存放1～2天后再用。由于微型盆景土少所含养分有限，如不能及时补肥，会引起树势早衰或枝叶枯萎。施肥应根据树种类别不同分别对待。
一般树种均在萌芽前用浸盆法施稀薄液肥1次，霉雨季节如气候条件适宜，植株生长旺盛时也应及时补肥。而对常绿针叶树类施肥量要控制，否则将会造成徒长。如是观花、观果类应在花前增施磷钾肥，以促使孕蕾多，开花艳丽。对观果树种开花后还应追施l～2次薄肥，以利果实的生长。
