棉花黄萎病拮抗真菌的筛选鉴定及其室内盆栽防效
摘 要: 从南疆阿拉尔新疆生产建设兵团16团和北疆沙湾新疆生产建设兵团144团连作10年以上且黄萎病发病严重的棉田采集24份棉花根际土,采用稀释平板法和平板对峙法对土样进行分离、筛选拮抗真菌。从中筛选出一株对棉花黄萎 病 有 较 强 拮 抗 作 用 的 真 菌 菌 株,编 号 为 NJZ12-2。抑 菌 试 验 和 室 内 盆 栽 防 效 试 验 结 果 表 明,NJZ12-2菌株对棉花黄萎病菌的抑菌率为58.67%,室内盆栽防治效果为52.41%~54.81%。并通过 PCR 扩增该拮抗菌株的ITS基因序列,在 NCBI中进行同源性比较,用 MEGA5.0构建系统发育树并结合形态学特征及生理生化指标,最终将菌株鉴定为 Acremonium sp.。
棉花黄萎病是由半知菌亚门丛梗孢目轮枝菌属大丽轮枝 菌(Verticillium dahliae Kleb)引起的维管束土传病害,具有寄主范围广、变异性强、有较强抗逆性等特点[1],这也是黄萎病发病猖獗的主要原因。目前,防治棉花黄萎病方面主要采用化学防治、选育抗病品种为主,农业防治为辅,但成果收效甚微[2-4]。利用生物防治黄萎病已成为研究热点[5]。拮抗菌大多存在于植物的根系和叶围,与植物有着棉花黄萎病是由半知菌亚门丛梗孢目轮枝菌属大丽轮枝 菌(Verticillium dahliae Kleb)引起的维管束土传病害,具有寄主范围广、变异性强、有较强抗逆性等特点[1],这也是黄萎病发病猖獗的主要原因。
目前,防治棉花黄萎病方面主要采用化学防治、选育抗病品种为主,农业防治为辅,但成果收效甚微[2-4]。利用生物防治黄萎病已成为研究热点[5]。拮抗菌大多存在于植物的根系和叶围,与植物有着很好的 亲 合 性,易 于 在 作 物 上 定 植,生 防 效 果 稳定[6]。拮抗菌分泌次级代谢产物,通过直接或间接的方式,达到阻碍或杀死病原菌的效果。ITS区段被广泛应用于真菌种群之间和种间分类学鉴定[7]。White等设计的ITS1 和ITS4 特异引物在真菌鉴定上具有快速、精准等优势[8-11]。
通过 GenBank数据库同源性比对,能提高真菌分类鉴定的准确性及效率,这为真菌分类鉴定提供了丰富的生物信息资源[12-15]。通过 对 南 疆 阿 拉 尔 新 疆 生 产 建 设 兵 团16团和 北 疆 沙 湾 新 疆 生 产 建 设 兵 团 144 团 连 作10年以上且黄萎病发病严重的棉田采集根际土进行分离、筛选,结合形态学观察对筛选出的拮抗菌进行分类鉴定。并进一步通过抑菌试验及室内盆栽防效试验进行生防潜力评价,为棉花黄萎病生防菌剂的研制及开发奠定基础。
目前,防治棉花黄萎病方面主要采用化学防治、选育抗病品种为主,农业防治为辅,但成果收效甚微[2-4]。利用生物防治黄萎病已成为研究热点[5]。拮抗菌大多存在于植物的根系和叶围,与植物有着很好的 亲 合 性,易 于 在 作 物 上 定 植,生 防 效 果 稳定[6]。拮抗菌分泌次级代谢产物,通过直接或间接的方式,达到阻碍或杀死病原菌的效果。ITS区段被广泛应用于真菌种群之间和种间分类学鉴定[7]。White等设计的ITS1 和ITS4 特异引物在真菌鉴定上具有快速、精准等优势[8-11]。
通过 GenBank数据库同源性比对,能提高真菌分类鉴定的准确性及效率,这为真菌分类鉴定提供了丰富的生物信息资源[12-15]。通过 对 南 疆 阿 拉 尔 新 疆 生 产 建 设 兵 团16团和 北 疆 沙 湾 新 疆 生 产 建 设 兵 团 144 团 连 作10年以上且黄萎病发病严重的棉田采集根际土进行分离、筛选,结合形态学观察对筛选出的拮抗菌进行分类鉴定。并进一步通过抑菌试验及室内盆栽防效试验进行生防潜力评价,为棉花黄萎病生防菌剂的研制及开发奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材 料
1.1.1 供试样品
2017年,在棉花苗期(5月21日)、现蕾期(6月24日)、花龄期(7月12日),从南疆阿拉尔新疆生产建设兵 团 16 团 和 北 疆 沙 湾 新 疆 生 产 建 设 兵 团144团连作10年以上且黄萎病发病严重的新疆农业大学农学院试验田中各随机选取4株长势良好的植株[16-18],采用5 点取样法,取深度为 15~20cm棉花根际土,采集 24 份土样。将土样装入保鲜袋内,注明采集土样时间、地点等,放置4℃冰箱保存。
供试病原菌:大丽轮枝菌(Verticillium dahli-ae)V991,属于高致病力落叶型菌株[19],由新疆农业大学农学院微生物实验室提供。
供试棉花品种:‘中棉44号’为高抗枯萎病、耐黄萎病品种,由新疆农业大学农学院保藏。
1.1.2 试剂与仪器
培养基:PDB培养基配制参照赵丽坤[20]方法。
试剂:Master Mix、dd H2O、10×buffer购于生工生物工程(上海)股份有限公司。正向引物ITS1:(5′-CTTGGTCATTTTAGAGGAAGTAA-3′) 和反 向 引 物 ITS4:(5′-CAGGAGACTTGTACACG-GTCCAG-3′),由上海华大基因科技有限公司合成。Easy Pure Plant RNA Kit试剂盒、切胶回收试剂盒购于生工生物工程(上海)股份有限公司。
仪器:电 泳 仪 (北 京 六 一 DYY-6D 型)、AlphaImager EP凝胶成像系统、PCR 梯度仪(EppendorfMastercycler?pro)、离心机(Eppendorf Centrifuge5418 R)、超 净 工 作 台 (Boxun)、压 力 灭 菌 锅。
1.2 方 法
1.2.1 土壤真菌的分离与纯化
参照方中达等[21]方法,采用稀释平板法进行土样分离。称取10g土样融于90mL无菌水中,置于摇床160r/min振荡30min后,静置5 min。然后对土壤悬液进行梯度稀释,用移液枪将稀释梯度为1×10-3、1×10-4、1×10-5的 土 壤 悬 液 吸 取0.1mL,接种于 PDA 培养基上,用无菌玻璃涂布棒涂布均匀,3次重复,28 ℃恒温培养2~3d,待菌丝长出,挑取形态、颜色不同的单菌落接种至新的培养基。2~3次单胞分离后,置于4 ℃冰箱保存。
1.2.2 拮抗真菌的初筛及复筛
参照周建云[22]等方法,采用平板对峙法进行拮抗真 菌 的 筛 选。 用 无 菌 打 孔 器 (Φ =7 mm)在V991菌落边缘打菌饼[26],置于 PDA 培养基中央。用接种环挑取分离土样获得的真菌菌丝,在距菌饼2cm 的位置进行接种,分别画3条长3cm 且两两垂直的直线,28 ℃恒温培养15d,设置对照组为不接种土壤真菌,每种菌重复3次,用游标卡尺测量抑菌圈的直径。
1.2.3 拮抗菌 NJZ12-2对棉花黄萎病菌丝生长的影响
将拮 抗 菌 NJZ12-2 菌 丝 接 种 于 PDA 培 养 基上,28 ℃恒温培养7d,用无菌打孔器 (Φ =7mm)制成菌饼[26],挑取 3~4 块菌饼置于 250 mL PDB培养基中,在摇床中28 ℃,160r/min震荡48h后,12 000r/min 离心20min,吸取上清液于灭菌离心管,10倍稀释分装,放置4 ℃冰箱保存。
用无菌打孔器 (Φ =7 mm)将病原菌 V991制成菌饼,将菌饼置于稀释过的拮抗菌菌悬液中浸泡30min,取出晾干,置于 PDA 培养基中央,28 ℃恒温培养15d。用十字交叉法测量菌落直径[23]。设置对照组为无菌水处理,重复3次[24]。
生长抑制率(%)= 〔D0- Dc/(D0- 7 )〕×100%
式中:D0为对照菌落直径;Dc为处理菌落直径。
1.2.4 拮抗菌株 NJZ12-2形态学观察
NJZ12-2株 菌 落 边 缘 用 无 菌 打 孔 器 (Φ =7mm)打菌饼,并转接至新培养基上,26 ℃恒温培养7d后,肉眼观察菌落形态特征。采用插片培养法做临时玻片,光学显微镜观察菌体特征,依据菌落特征、分生孢子梗、分生孢子等特征并参照《真菌鉴定手册》[25]对菌株初步鉴定。
1.2.5 拮抗菌株 NJZ12-2的ITS序列扩增
参照 Easy Pure Plant RNA Kit试剂盒说明书提取菌株 NJZ12-2基因组 DNA,采用真菌通用引物ITS1、ITS4 序 列 对 菌 株 的 ITS 序 列 进 行 PCR 扩增。25μL 反 应 体 系:2 × PCR Master Mix12.5μL;DNA 模板2μL,10μmol/L的引物ITS1、ITS4各1.0μL,ddH2O 8.5μL。反应条件:94℃预变性5min;94℃变性30s、56℃退火30s、72℃延伸1min,共30个循环;72℃延伸10min,4℃终止反应。 配 制 浓 度 为 0.8% 的 琼 脂 糖 凝 胶,在 恒 压150V,电泳40 min。用 切 胶 回 收 试 剂 盒 对 样 品 做DNA 回收操作,样品送上海华大有限公司测序。